Проводится регулярный семинар «Архитектура, системное и прикладное программное обеспечение кластерных суперЭВМ» на базе ССКЦ, кафедры Вычислительных систем НГУ и Центра Компетенции по высокопроизводительным вычислениям СО РАН - Intel.
Заседания семинара проходят в конференц-зале ИВМиМГ СО РАН по четвергам в 11-00.
Презентации последних семинаров:
МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАЗМЕННОГО КИЛЬВАТЕРНОГО УСКОРЕНИЯ
Докладчики: Константин Владимирович Лотов (ИЯФ СО РАН), Александр Павлович Соседкин (ИЯФ СО РАН).
Плазменное кильватерное ускорение — молодое и перспективное направление в области ускорения заряженных частиц. Суть явления сводится к инжектированию частиц в плазму совместно с ультрарелятивистским драйвером, возмущающим плазменные волны и передающим таким образом энергию ускоряемым частицам. В будущем метод сулит возможность разгона пучков до рекордных параметров в коротких линейных ускорителях. В докладе будут доступно изложены физические основы явления, кратко описаны принципы его моделирования и используемый способ распараллеливания вычислений, а также высказаны впечатления и пожелания, возникшие в ходе использования ЦКП ССКЦ.
СИСТЕМА АВТОМАТИЗАЦИИ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ
Докладчик: Юрий Юрьевич Васькин (ИВМиМГ СО РАН и Politecnico di Milano).
Решение задач потоковой доставки данных биологу, организации разностороннего доступа к полученным экспериментальным данным с помощью предметно-ориентированных языков и вычислительных конвейеров. Отработка методов и систем, которые могут быть применены для решения аналогичных задач в других научных областях.
ПОЛУЧЕНИЕ ОДНОМЕРНЫХ СТРУКТУР (НЕОРГАНИЧЕСКИХ ПОЛИМЕРОВ) МЕТОДОМ ТЕМПЛАТНОГО СИНТЕЗА
Докладчики: И. Ю. Просанов (Институт химии твёрдого тела и механохимии СО РАН), E. Benassi (Scuola Normale Superiore di Pisa, Italy)
Решается задача синтеза неорганических полимеров - галогенидов, оксидов/гидроксидов и халькогенидов. Их стабилизация достигается использованием органической матрицы. Для установления структуры этих материалов применяется комбинированный подход, включающий компьютерное моделирование структуры и свойств и сравнение рассчитанных и экспериментально наблюдаемых колебательных спектров. Среди получаемых неорганических полимеров такие важные для приложений соединения как: CuO, ZnO и CdS.
ПРОВАЛ ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТИ GPU В АЛГОРИТМАХ С ПРОИЗВОЛЬНЫМ ДОСТУПОМ К ПАМЯТИ
Докладчики: к.т.н. Александр Владимирович Кашковский, к.ф.-м.н. Антон Алексеевич Шершнёв (ИТПМ СО РАН)
Расчеты на ГПУ Tesla K40 методом прямого статистического моделирования (ПСМ) показали катастрофическое падение вычислительной производительности при увеличении объема задачи. Причиной этого оказалось уменьшение в десятки раз скорости произвольного доступа к памяти, который используется в алгоритме метода ПСМ. Как оказалось, это происходит практически на всех ГПУ с большим объемом памяти. Предложены способы учета этой особенности ГПУ и алгоритмы, позволяющие преодолеть эту проблему и повысить производительность.
ТЕХНОЛОГИЯ МОДЕЛИРОВАНИЯ УПРУГИХ ВОЛН В СРЕДАХ СО СЛОЖНОЙ 3D ГЕОМЕТРИЕЙ ПОВЕРХНОСТИ НА ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫХ КЛАСТЕРАХ. КРАТКИЙ ОБЗОР DVM-СИСТЕМЫ ДЛЯ РАЗРАБОТКИ ПАРАЛЛЕЛЬНЫХ ПРОГРАММ
Докладчик: Титов Павел Андреевич (ИВМиМГ СО РАН)
В работе рассматривается параллельный алгоритм моделирования 3D упругих волн для случая, когда свободная поверхность области моделирования имеет значительную кривизну. В алгоритме используется построение криволинейной сетки, хорошо согласованной с формой свободной поверхности. Проведены расчеты на кластере НКС-30Т, представлены результаты тестов на ускорение и масштабируемость.
Также, в работе сделан краткий обзор DVM-системы (www.dvm-system.org). Она представляет собой расширения языков C и Fortran спецификациями параллелизма, оформленных в виде директив к компилятору. Система позволяет создавать эффективные параллельные программы (DVMH-программы) как для классических многоядерных, так и для гетерогенных архитектур. В нее также включены средства функциональной отладки и отладки эффективности DVMH-программ.
На примере алгоритма автора были проведены сравнительные тесты для программы, распараллеленной вручную, а также при помощи DVM-системы.
РАЗРАБОТКА ЧИСЛЕННЫХ МЕТОДОВ И АЛГОРИТМОВ РАСЧЕТА ВОЛНОВЫХ СЕЙСМИЧЕСКИХ ПОЛЕЙ В СРЕДАХ С ЛОКАЛЬНЫМИ ОСЛОЖНЯЮЩИМИ ФАКТОРАМИ
Докладчик: к.ф.-м.н. Лисица Вадим Викторович (ИНГГ СО РАН)
В работе рассматривается проблема численного моделирования волновых сейсмических процессов в средах с локальными осложняющими факторами: скопления мелкомасштабных неоднородностей, анизотропные и вязкоупругие включения, наличие резкоконтрастных границ со сложной геометрией. Предлагаемые в работе подходы основаны на комплексировании разных численных методов, так что ресурсоемкие и вычислительно сложные методы используются локально. В частности, для учета мелкомасштабной структуры пластов используется локальное пространственно-временное измельчение сеток. Расчет решения моделях со сложной топографией свободной поверхности проводится на основе комбинирования разрывного метода Галеркина, который используется в верхней части модели, и метода конечных разностей.
Отказоустойчивая инженерная инфраструктура ЦОД и серверных комнат от APC.
Докладчик:Евгений Камардин, менеджер по работе с региональными заказчиками, Шнейдер Электрик.
High Performance Computing on Power Systems
Докладчик: Жиловский Геннадий Станиславович, зам. директора ООО НПК "КОНТАКТ"
Небольшой обзорный доклад.
Технология IBM MicroLatency и архитектура IBM Flash System.
Докладчик: Захаров Станислав Александрович, ведущий инженер отдела инфраструктурных решений ООО НПК "КОНТАКТ"